Проверить можно что-то типа такого (от рута в коммандной строке, как find-ом посчитать не знаю):
Код
perl -e '$homeDir="/home";$cgiDir="public_html/cgi-bin";opendir(DIR, "/home/");@users = grep { !/^\./ && -d "$homeDir/$_/$cgiDir" } readdir(DIR);closedir DIR;foreach (@users){opendir(DIR, "$homeDir/$_/$cgiDir");$count++ if scalar grep { !/^\./} readdir(DIR);closedir DIR;}print "\n\nTotal: $count\n\n";'
ну и поменять /home и public_и html/cgi-bin в начале, если у вас другая структура
Ну и в комментах отпишитесь сколько всего клиентов и у какой части из них есть perl