Всё зависит от панели.
У нас стоит Debian 3.1 - панелька VHCS (кстати, Open Source) написана для этой системы, конфиг панельки можно даже не менять. Не знаю как в других ОС, но тут есть такое средство как apt-get - с помощью него даже новичок сможет поставить весь требуемый софт путём набирания пары команд - он сам поставится, сконфигурируется, установит какие-либо зависимые пакеты и всё такое... Если хочется - можно пойти открыть конфиг и понастраивать.
Я не особо вникаю в это, но мой бывший препод по линуксу довольно плохо отзывался о тех провайдерах, кто ставил фришку, он это обосновывал, вообщем я понял, что фришка плохо, шляпа хорошо

...