Скажите, а можно заставить cron выполнять скрипт из папки закрытой паролем в .htaccess?

У меня есть скрипт, который я не хочу, чтобы кто-то случайно запускал кроме cron. Я его прячу в папку и закрываю ее паролем. Вот только сомневаюсь, а cron оттуда его сможет запустить или нет. Скрипт на ПХП.

Если ты будешь запускать его как обычный скрипт, т.е. php scriptname, то он естественно запуститься.
Для большей секурности его вообще можно убрать из каталогов доступных веб-серверу.