У меня вопрос ко всем ресселлерам, часто ли у Вас возникали проблемы с созданием днс зоны для клиента, заключающейся в невозможности её создания из-за наличия днс зоны данного клиентского домена у другого ресселлера этого же хостинг-провайдера

Очень распространенная проблема, особенно на серверах, где размещаются одни реселлеры.

Думаю, что уже многие сталкивались с такой неприятностью, особенно наверно сложно объяснить клиенту, что ты не можешь открыть ему аккаунт с этим доменным именем, так как этот домен уже присутствует на сервере.

Да, эта ситуация достаточно частая. Для решения обычно бывает достаточно связаться с прошлым "хостером" клиента и объяснить ситуацию или с вышестоящим хостером.