А вобще как сделать чтоб mod_perl не работал с апачаеского правами

То есть сменить пользователя....???????

И возможно ли к каждому виртуальному хосту сделать чтоб он запускался со своими правами....

suexec поставить, mod_perl убрать.
Можно настроить чтоб скрипты запускались с правами владельца.

suexec уже есть
mod_perl не могу убрать так как мне надо чтоб скриптике по быстрей выполнялись

А можно еще посмотреть в сторону fast-cgi. будет и быстро и с правами все как надо.

Еще помоему у перла есть модуль SpeedyCGI, то же что-то для увеличения производительности.

Можно апач запустить сразу с правами юзера.

Плюс вместо mod_php лучше и проще fast_cgi юзать.